Sebagai sebuah jemaat, GKMI ARK terdiri dari berbagai kalangan dan usia. Oleh karenanya, komisi-komisi dibentuk untuk menjangkau dan melayani masing-masing segmen tersebut. Hingga saat ini, terdapat 4 komisi pelayanan di GKMI ARK, yaitu ARK Kids (sekolah minggu), Komisi Remaja, Dynamic Youth Fellowship (pemuda), dan Komisi Perempuan.